Bioindication diatomées : comparaison microscopie / barcoding ADN. Pipeline MOTHUR selectionné

DOI

Le pipeline sélectionné pour produire les listes floristiques utilisées pour calculer les IBD des 447 échantillon est donné ci dessous

Les données fastq sont disponibles au DOI suivant :

Rivera, Sinziana; Vasselon, Valentin; Chardon, Cécile; Guéguen, Julie; Bouchez, Agnès; Rimet, Frédéric, 2018, "Bioindication diatomées : comparaison microscopie / barcoding ADN. Données brutes Fastq 2016 + 2017, Test des différentes stratégies bioinfo sur données 2016. Projet AFB numéro 15000239 / A30.", https://doi.org/10.15454/9EG5Z4, Portail Data Inra, V1 https://data.inra.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi%3A10.15454%2F9EG5Z4

Les listes floristiques, les IBD des 447 échantillons produits en microscopie et ADN sont disponibles au DOI suivant:

Rivera, Sinziana; Vasselon, Valentin; Chardon, Cécile; Jacas, Louis; Guéguen, Julie; Bouchez, Agnès; Rimet, Frederic, 2018, "Bioindication diatomées : comparaison microscopie / barcoding ADN. Listes floristiques, indices IBD. Projet AFB numéro 15000239 / A30.", https://doi.org/10.15454/WNI6FQ, Portail Data Inra, V1 https://data.inra.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi%3A10.15454%2FWNI6FQ

Identifier
DOI https://doi.org/10.15454/1OTGWL
Metadata Access https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/oai?verb=GetRecord&metadataPrefix=oai_datacite&identifier=doi:10.15454/1OTGWL
Provenance
Creator Rivera, Sinziana; Vasselon, Valentin; Chardon, Cécile; Jacas, Louis; Guéguen, Julie; Bouchez, Agnès; Rimet, Frédéric
Publisher Recherche Data Gouv
Contributor Rimet, Frederic
Publication Year 2019
Rights etalab 2.0; info:eu-repo/semantics/openAccess; https://spdx.org/licenses/etalab-2.0.html
OpenAccess true
Contact Rimet, Frederic (INRA - Institut National de la Recherche Agronomique)
Representation
Resource Type Workflow; Dataset
Format application/octet-stream; application/x-msdownload; text/plain; text/tab-separated-values
Size 338827; 804864; 386179; 17079808; 62; 391720; 177379; 32176; 404618; 6591456
Version 1.0
Discipline Life Sciences; Microbial Ecology and Applied Microbiology; Biology; Omics