Van 10 tot 12 februari 2003 en op 18 maart 2003 is in de Gasthuisstraat archeologisch onderzoek gedaan ter begeleiding van grondwerkzaamheden. Hierbij is onder andere gezocht naar sporen van de oude Geesterpoort. In totaal zijn drie werkputten aangelegd (zie afbeelding 7). Werkput 1 en 2 zijn aangelegd ten behoeve van boomkuilen. Aangezien de rooilijn van de Gasthuisstraat in de 20de eeuw is teruggezet, is in deze kuilen gezocht naar eventuele resten van oude bebouwing. Op de locatie van werkput 1 bleek de grond echter compleet verstoord te zijn door de 20de eeuwse riolering en de werkput is daarom niet verder gedocumenteerd. Wel zijn er een aantal monsters genomen van de los aangetroffen kloostermoppen. Werkput 2 was gesitueerd op de plaats waar de rooilijn van de vroegere bewoning lag. Verwacht werd dan ook, dat er sporen van de voorgevels van de huizen aangetroffen konden worden. Echter, de grond was erg verstoord. Uit het profiel dat getekend is, kwamen een paar baksteenfragmentjes, die voor onderzoek mee zijn genomen. Behalve het profiel is deze werkput niet verder gedocumenteerd. Vlak naast de ingang van de ABNAmro-bank werd werkput 3 aangelegd, teneinde onderzoek te doen naar eventuele restanten van de oude stadspoort. De grond was hier niet verstoord en de resten bleken daadwerkelijk nog aanwezig te zijn. Deze werkput is in twee vlakken opgegraven en nog naar het westen uitgebreid, waar de andere kant van de poort en de muur van het voorhof werden aangetroffen. Op 18 maart is aan de andere kant van de ingang van de bank, ter hoogte van de hoek van Zevenhuizen en de Gasthuisstraat nog een uitbreiding van werkput 3 aangelegd (Werkput 3b. Met de aanleg van deze werkput is geprobeerd om uitsluitsel te geven over de westgevel van de voorhof bij de stadspoort. De Utrechtse Weerdsepoort had hier nog twee kleine ronde hoektorens en dat zou ook bij onze Geesterpoort het geval kunnen zijn geweest. De aanwezige gas- en waterleidingen verhinderde echter het diepe graafwerk. Uit de verstoringen kwamen stukken kloostermoppen en fragmenten aardewerk. Gezien de kleine ruimte tussen de poort en de overkant van de gracht, zal een rechte afwerking wel waarschijnlijker geweest zijn.