SweGen: en kartläggning av den genetiska variationen hos 1000 svenska individer

DOI

The SweGen contains whole-genome variant frequencies for 1000 Swedish individuals generated within the SweGen project. The data is intended to be used as a resource for the research community and clinical genetics laboratories. DNA from blood samples were whole genome sequenced using Illumina X technology at SciLifeLab Uppsala and SciLifeLab Stockholm. The sequencing data was analyzed with the GATK best practices pipeline to obtain a joint called variant frequency dataset. For more information, see: https://www.nature.com/articles/ejhg2017130

SweGen är ett dataset som innehåller information om den genetiska variationen hos 1000 svenska individer, baserat på helgenomsekvensering. Datat är tänkt att användas som en generell resurs för forskare och kliniskt verksamma. DNA från blodprover helgenomsekvenserades med Illumina's X Ten instrument hos SciLifeLab Uppsala och SciLifeLab Stockholm. Sekvensdata analyserades med GATK's verktyg för inpassning och variantdetektion för att skapa ett dataset med genetiska frekvenser. För mer information, se: https://www.nature.com/articles/ejhg2017130

Registry extract and/or access to biobank sample

Registerutdrag och/eller tillgång till prov i biobank

Identifier
DOI https://doi.org/
Metadata Access https://datacatalogue.cessda.eu/oai-pmh/v0/oai?verb=GetRecord&metadataPrefix=oai_ddi25&identifier=2e04b9f44685518859adc8d81a6f23e390db59b9261764b696995f632a8a4757
Provenance
Creator Ameur, Adam; Gyllensten, Ulf
Publisher Swedish National Data Service; Svensk nationell datatjänst
Publication Year 2019
Rights Access to data through an external actor. Access to data is restricted.; Åtkomst till data via extern aktör. Tillgång till data är begränsad.
OpenAccess false
Contact https://snd.gu.se
Representation
Discipline Biology; Life Sciences; Medicine