Phenotypic trait and leaf phenology dataset (1993 - 2022) of Juglans sp. from common gardens in France

DOI

Données sur des caractères phénotypiques de Juglans regia, Juglans nigra et Juglans regia x J. nigra mesurés dans les jardins communs du réseau INRAE de génétique forestière pour la recherche et l'expérimentation (GEN4X). Ce jeu de données est composé d'observations telles que la hauteur totale, la circonférence, la survie, l'architecture et le débourrement végétatif, réalisées entre 1993 et 2022 dans sept jardins communs du réseau GEN4X : deux tests de provenances, quatre tests de descendances et un test clonal. Les tests sont installés dans des conditions environnementales variées dans le sud de la France. Les jardins communs ont été plantés entre 1993 et 1995 et contiennent chacun entre 200 et 1182 individus, pour un total de plus de 3000 individus. Chaque jardin commun compare entre 8 et 33 génotypes. En comptant les génotypes présents à titre de référence, ce sont 165 génotypes des genres Juglans et Pterocarya qui sont représentés dans ces set jardins communs. Ce type de données de caractères phénotypiques liés à la valeur sélective peuvent être utilisés pour tester l'ampleur et la structuration de la diversité génétique, la plasticité phénotypique et l'adaptation locale dans des conditions variées de sols et de climats. L'archive contient onze fichiers. Le fichier "Desciption_Genotypes_Juglans" contient les métadonnées sur les accessions (provenances, descendances, clones). Le fichier "Description_Jardins_Communs_Juglans" contient les métadonnées sur les sites de plantation. Les deux fichiers texte "Readme" décrivent les données et les entêtes des champs des fichiers de description. Chacun des sept fichiers restants contient les données phénotypiques, un fichier par jardin commun.

Phenotypic trait dataset of Juglans regia, Juglans nigra and Juglans regia x J. nigra measured in common gardens of the Forest Genetics Network for Research and Experimentation (GEN4X) of INRAE. This dataset is made of observations such as total height, circumference, survival, architecture and leaf phenology, carried out between 1993 and 2022 in seven common gardens of the GEN4X network: two provenance tests, four progeny tests and one clonal test. The tests are set up in a variety of environmental conditions in the south of France. The commun gardens were planted between 1993 and 1995 and each contains between 200 and 1182 individuals, for a total of over 3000 individuals. Each common garden compares between 8 and 33 genotypes. Including reference genotypes, 165 genotypes of the Juglans and Pterocarya genera are represented in these common gardens. This type of data on phenotypic traits linked to selective value can be used to test the extent and structure of genetic diversity, phenotypic plasticity and local adaptation under a variety of soil and climatic conditions. The archive contains eleven files. The "Desciption_Genotypes_Juglans" file contains metadata on accessions (provenances, half-sibs, clones). The "Description_Jardins_Communs_Juglans" file contains metadata on planting sites. The two "Readme" text files describe the data and field headers of the description files. Each of the seven remaining files contains phenotypic data, one file per common garden.

Identifier
DOI https://doi.org/10.57745/EO5U7Y
Related Identifier IsCitedBy https://doi.org/10.1023/A:1022939609548
Metadata Access https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/oai?verb=GetRecord&metadataPrefix=oai_datacite&identifier=doi:10.57745/EO5U7Y
Provenance
Creator Fady, Bruno ORCID logo; Vauthier, Denis; Marty, Maud; Michotey, Celia ORCID logo
Publisher Recherche Data Gouv
Contributor Fady, Bruno; Marty, Maud; Vauthier, Denis; Boyer, Christine; Duval, Hervé; Willm, Jérôme; Rei, Franck; Gilg, Olivier; Thévenet, Jean; Giai-Checca, André; ECODIV; Ecologie des Forêts Méditerranéennes
Publication Year 2024
Rights info:eu-repo/semantics/openAccess
OpenAccess true
Contact Fady, Bruno (INRAE - URFM); Marty, Maud (INRAE - URGI)
Representation
Resource Type Dataset
Format text/tab-separated-values; text/plain
Size 183579; 442946; 53905; 26290; 136105; 23244; 29792; 14724; 2625; 57706; 7421
Version 2.1
Discipline Agriculture, Forestry, Horticulture; Computer Science; Geosciences; Life Sciences; Agricultural Sciences; Agriculture, Forestry, Horticulture, Aquaculture; Agriculture, Forestry, Horticulture, Aquaculture and Veterinary Medicine; Earth and Environmental Science; Environmental Research; Medicine; Natural Sciences