In het kader van de sloop en nieuwbouw van het Muziekcentrum Vredenburg zijn in 2008 en 2009 diverse archeologische begeleidingen en onderzoeken uitgevoerd naar de resten van het zestiende-eeuwse kasteel Vredenburg. De onderzoeken hebben met name detaillering en aanvullingen van eerder onderzoek opgeleverd. Ook zijn in de slotgracht enkele interessante vondsten gedaan.
Naast materiaal dat van het kasteel afkomstig was, kwamen er uit de slotgracht ook vondsten tevoorschijn die naar een meer religieuze context verwijzen. Het betreft beeldhouwwerk, bestaande uit een (deel van) een vrouwenkop en een deel van een zuiltje. De vrouwenkop is beschilderd met rode verf. Op basis van de haar- en klederdracht is een datering rond 1500 waarschijnlijk. Zowel de kop als de zuil lijken losgebeiteld te zijn om de ruwe natuursteen te kunnen hergebruiken.
In de slotgracht zijn ook fragmenten van menselijk botmateriaal aangetroffen. Aangezien het om mannen en vrouwen, en dan zowel kinderen als volwassenen, ging, is het mogelijk dat het materiaal afkomstig is van graven op het kloosterterrein van het Johannieterklooster, als hier tenminste ook mensen begraven zijn die gestorven zijn in het bijbehorende hospitaal.
